In Baarle-Nassau wordt naar aanleiding van de landinrichting nieuwe natuur aangelegd. Er zijn drie projecten die voorzien in grootschalige natuurontwikkeling. Als gevolg hiervan wordt het leefgebied van met name amfibieën, reptielen, vlinders, libellen en kleine zoogdieren versterkt. Dit is van belang nu veel soorten, zoals de Boomkikker, Kamsalamander en het Bont Dikkopje met uitsterven worden bedreigd. Alle drie de projecten voorzien in het natuurlijk inrichten van de beken, hebben als doel de waterkwaliteit te verbeteren, te voorzien in waterberging en een bijdrage te leveren aan herstel van de ecologische waarden in het gebied. De projecten zijn inmiddels (grotendeels) afgerond. 

Project Ulicoten Noord

Het eerste project is Ulicoten Noord in het uiterste noordwesten van de gemeente. Ter plaatse wordt drainage verwijderd en sloten gedempt om zo een hogere grond waterstand te verkrijgen. Ook wordt het Diepven, het Poetjesven en het groot Vergoorven in ere hersteld en wordt een bijdrage geleverd aan de verwezenlijking van de ecologische hoofdstructuur. Verder wordt nabij het Goordonk, Maaijkant en Nonnenven het landschap hersteld door de aanleg van struweel, bloemrijk grasland, vennen en drassige laagten. Het gebied is onderdeel van het landelijk netwerk van natuurgebieden, de zogenaamde ecologische hoofdstructuur.

Project Withagen

Ten tweede wordt er bij de Withagen veel natuur gerealiseerd zodat een aaneengesloten areaal ontstaat. Ook dit gebied maakt onderdeel uit van de ecologische hoofdstructuur. Het project heeft een uitloper naar het zuidoosten waar het een flinke aanzet geeft voor onder meer de ecologische verbindingszone Poolsheining. Het project loopt helemaal door tot de Hollandse Bossen en beslaat ook de beek Bremer. Het project wordt gekenmerkt door de aanleg van een flink aantal poelen. Bij de Wildertsebaan/Nieuwe Strumptsebaan wordt natuur gecreëerd met onder andere heide en bij het gebied Withagen wordt veel bloemrijk grasland aangelegd. Op sommige stukken vind een noodzakelijk verschraling van de grond plaats om zo een voedselarm milieu te creëren.

Project Merkske

Het derde project is Merske Oost. Dit project strekt zich uit van net ten zuiden van Withagen tot het Eendegoorven ten zuidoosten van landgoed Schaluinen. In dit project wordt een aanzet gegeven voor de ecologische verbindingszones Schouwloop en Olgaloop. Voorts wordt een natte verbinding gelegd van diverse poelen tussen Withagen en de Kromme Hoek en wordt een moeras gecreëerd ten oosten van Baarlebrug. Het accent van het project ligt echter op het gebied de Manke Goren. De natuur die hier gerealiseerd wordt heeft baat bij een hoge grondwaterstand. Daarom wordt net als bij het afgeronde project in Castelré drainage verwijderd.